Σημαντική θεσμική παρέμβαση στο Ευρωπαϊκό Κοινοβούλιο πραγματοποίησε ο Μανώλης Κεφαλογιάννης ως πρόεδρος της Μικτής Κοινοβουλευτικής Επιτροπης ΕΕ-Τουρκίας με την κατάθεση σειράς καίριων τροπολογιών στην έκθεση του Ευρωπαϊκού Κοινοβουλίου για την ενταξιακή πορεία της Τουρκίας, με στόχο την ξεκάθαρη υπεράσπιση του Διεθνούς Δικαίου, του ευρωπαϊκού κεκτημένου και των κυριαρχικών δικαιωμάτων των κρατών-μελών της Ευρωπαϊκής Ένωσης.
Όπως τόνισε ο Μανώλης Κεφαλογιάννης:
«Η Ευρωπαϊκή Ένωση δεν μπορεί να κάνει εκπτώσεις στις θεμελιώδεις αρχές της. Η πρόοδος των ευρωτουρκικών σχέσεων μπορεί να υπάρξει μόνο στη βάση του πλήρους σεβασμού του Διεθνούς Δικαίου, του ευρωπαϊκού κεκτημένου και των κυριαρχικών δικαιωμάτων όλων των κρατών-μελών της Ευρωπαϊκής Ένωσης, συμπεριλαμβανομένων της Ελλάδας και της Κυπριακής Δημοκρατίας».
Οι τροπολογίες που καταθέσαμε αναδεικνύουν με σαφήνεια ότι ο σεβασμός της κυριαρχίας όλων των κρατών-μελών της ΕΕ και η πλήρης αναγνώρισή τους από την Τουρκία αποτελούν αδιαπραγμάτευτη προϋπόθεση για οποιαδήποτε ουσιαστική πρόοδο στις ενταξιακές της διαπραγματεύσεις.»
Παράλληλα επισημαίνεται ότι η Σύμβαση των Ηνωμένων Εθνών για το Δίκαιο της Θάλασσας (UNCLOS), αποτελεί αναπόσπαστο μέρος του ευρωπαϊκού κεκτημένου και θεμελιώδη πυλώνα της διεθνούς έννομης τάξης.
Στις τροπολογίες υπογραμμίζεται επίσης το πλαίσιο περιοριστικών μέτρων που υιοθέτησε η Ευρωπαϊκή Ένωση το 2019 ως απάντηση στις παράνομες γεωτρητικές δραστηριότητες της Τουρκίας στην Ανατολική Μεσόγειο, ενώ εκφράζεται έντονη ανησυχία για τη συνεχιζόμενη αμφισβήτηση της κυριαρχίας και των κυριαρχικών δικαιωμάτων κρατών-μελών της ΕΕ, όπως η Ελλάδα και η Κυπριακή Δημοκρατία.
Ιδιαίτερη αναφορά γίνεται στην αναθεωρητική ρητορική που εκφράζεται μέσω της λεγόμενης «Γαλάζιας Πατρίδας», στις θεωρίες περί «γκρίζων ζωνών» στο Αιγαίο και στην προσπάθεια σύνδεσης της αποστρατιωτικοποίησης των ελληνικών νησιών του Ανατολικού Αιγαίου με ζητήματα κυριαρχίας, θέσεις που αντιβαίνουν ευθέως στο Διεθνές Δίκαιο και τις αρχές της Ευρωπαϊκής Ένωσης.
Οι τροπολογίες καταγράφουν επίσης τη σοβαρή πρόκληση που συνιστά η διατήρηση της απειλής πολέμου (casus belli) κατά της Ελλάδας, σε περίπτωση άσκησης του νόμιμου και κυριαρχικού της δικαιώματος για επέκταση των χωρικών της υδάτων στα 12 ναυτικά μίλια, όπως προβλέπεται ρητά από τη Σύμβαση του ΟΗΕ για το Δίκαιο της Θάλασσας.
Παράλληλα επισημαίνεται ότι το λεγόμενο μνημόνιο Τουρκίας-Λιβύης για την οριοθέτηση θαλάσσιων ζωνών παραβιάζει τα κυριαρχικά δικαιώματα τρίτων κρατών και δεν μπορεί να παράγει έννομα αποτελέσματα σύμφωνα με το Διεθνές Δίκαιο.
Στις τροπολογίες τονίζεται,επίσης, η ανάγκη σεβασμού της πολιτιστικής και θρησκευτικής κληρονομιάς, με αναφορά στην Αγία Σοφία, τη Μονή της Χώρας, τη Μονή Παναγίας Σουμελά και την ανάγκη επαναλειτουργίας της Θεολογικής Σχολής της Χάλκης, καθώς και η προστασία των δικαιωμάτων των θρησκευτικών και εθνοτικών μειονοτήτων στην Τουρκία.